口腔预防科于2018年3月从原口腔预防儿童口腔科独立成科，承担儿童口腔疾病诊疗、口腔疾病群体预防、全生命周期口腔健康管理、人才培养及科研等工作。
门诊主要开展儿童口腔疾病的诊疗，特色项目为儿童龋风险评估及分级管理、乳/恒牙活髓保存术、恒牙根尖诱导术、牙髓血运重建术等。
科室特色为承担各级口腔疾病预防公共卫生项目、科普宣传等社会公益性工作，负责“全国儿童口腔疾病综合干预项目”等国家级公益项目在云南的实施和督导，获“全国口腔健康指导中心”“云南省青少年口腔健康教育基地”、全国“整合资源 健康口腔-多模式口腔疾病防治”工作中“最具影响力单位”，科普获奖50余项。
